Перу разделен на четыре заповедных региона, два из которых включены в бассейн Амазонки: Selva Alta (Верхняя сельва) и Selva Baja (Нижняя сельва), на их территории находятся 30 охраняемых заповедников (всего в Перу их 67), имеющих различные уровни протекции bio-разнообразия и поддерживающей его экосистемы.

Верхняя сельва или Rupa Rupa (400 – 1 000 м высоты над уровнем моря) представлена очень крутыми географическими рельефами, хотя имеет достаточно долин, почти совершенно гладких. Полноводные реки, впадающие в Амазонку, несут свои воды через глубокие каньоны, разрезая горные цепи и образуя pongos, что на кечуа звучит как puncu и означает дверь.

Климат очень влажный, жаркий днем и немного прохладный ночью. В сезон дождей (между ноябрем и апрелем) выпадает от 3 до 8 мм осадков, а в течение мая и октября дожди бывают редко.

Флора представлена несколькими экологическими уровнями, благодаря чему, на один гектар приходится более 200 биологических видов. Деревья более распространены в верхней и средней частях Рупа Рупа: pasayo (Bombax бесцветный), catahua (Hura crepitans), llishi (Jacquinia pubescens), также различные виды пальм: huicungo (Astrocaryum huincungo), shapaja (Scheelea cephalotes). Над деревьями изобилуют эпифиты: Tillandsia, Guzmania, Pitcairnia, кроме того орхидеи, папоротник и лианы.

Кусты в этой местности внешне схожи с травами: laurel (Myrica pubescens), tangarana (Triplaris pavonii) и la coca (Erythroxylum coca).

В нижней части региона растут густолиственные и очень высокие (50 метров) леса. Почва усеяна упавшими ветвями и деревьями, образующими естественные лабиринты, пока descampados используют травы и кусты, чтобы царить в своем царстве. Среди наиболее часто встречающихся видов деревьев можно выделить capirona (Calycophyllum spruceanum), huito (Genipa Americana), кедр (Cedrela odorata), caucho (Hevea brasiliensis) и др. Среди кустов – Heliconia rostrata, Amaryllis ferreyrae, Brunfelsia grandiflora и др.

Фауна этого региона не менее удивительна и интересна, например, большим количеством видов птиц (из 8 500 в мире, по меньшей мере, 1700 обитают в Перу): el gallito de las rocas, многочисленные trompetosos, periquitos y guacamayos (более 50 видов), hoatzin или shansho, tucanes, tinamus, martinpescadores, momotos, garzas более сотни видов колибри, едва ли заканчивающих этот список.

Млекопитающие есть как в верхней, так и в нижней сельве, но вынуждены постоянно менять зоны своего обитания, из-за дождей, наводнений, засухи или просто спасаясь от присутствия человека. Одно из самых больших животных sachavaca или американский тапир, достигает в длину 2,5 м. Sajino или дикий кабан (Tayassu tajacu) ценится кожей и мясом.

Среди млекопитающих встречается huangana (Tayassu pecari), ronsoco или capibara – самый большой грызун в мире, venado rojo (Mazama Americana rufa), otorongo или американский тигр, леопард, пума (Puma concolor), pelejo или oso perezoso de tres dedos (трехпалый ленивец) или двупалый de dos dedos (Choloepus hoffmanni), armadillo (Dasypus novemcintus), nutria del rio (водяная нутрия), delfin Rosado (Розовый дельфин), manati и др.

Очень распространены приматы: mono huapo rojo, mono huapo negro, choro comun, choro cola amarilla (Lagothrix flauvicauda), frailecillo (Saimiri bolivensis), titi (Cebuella pygmaea), pichico comun (обычный) и pichico pecho anaranjado, machin negro и др.

Змеи имеются в обеих зонах сельвы: anaconda, boa constrictora o mantona, boa arco iris (Epicrates cenchria), falsa maca maca (Erythrolamprus aesculapii-aesculapii), shushupe (Lachesis muta) и jargon de arbol (Leptodeira annulata annulata).

Среди черепах назовем charapa de fango (Platemys playcephala), charapita de aguajal (Phrynops nasuta), motelo (Geochelone denticulate), matamata и taricaya. Другие амазонские рептилии: ящерица, черный кайман, белый кайман, lagartija или ameiva gigante, игуана (Tupinambis teguixin), хамелеон и др.

Среди batracios Амазонии можно встретить sapo comun (жаба общего вида) (Bufo marinus), rana (лягушка) cornuda или rana Diablo (Ceratoprhys cornuta), разновидность древесных лягушек, живущих на листьях деревьев, некоторые из них ведут ночной образ жизни: Hyla fasciata, Hyla rhodopepla, Osteocephalus mimeticus, Phyllomedusa tomopterna, Phyllomedusa tarsius. Также представлены ядовитые лягушки, выделяющиеся ярким окрасом и свечением кожного покрова: Epipedobates bassleri, Ameerega zaparo, Dendrohates silverstonei -rana dardo venenoso- и Dendrohates trivitattus.